Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChmQ9QXG2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChmQ9QXG2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms