Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms