Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cul3Q9JLV5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms