Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpc4apQ9JLV2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms