Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Higd1aQ9JLR9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Higd1aQ9JLR9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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