Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlr5Q9JLF7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms