Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SacsQ9JLC8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SacsQ9JLC8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms