Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upk3aQ9JKX8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms