Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms