Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Stx6Q9JKK1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms