Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.2 ms