Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Stx12Q9ER00 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms