Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef4Q9EQZ6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef4Q9EQZ6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms