Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpgrip1Q9EPQ2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms