Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rarres2Q9DD06 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rarres2Q9DD06 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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