Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnft1Q9DCN7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms