Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9DA42 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9DA42 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9DA42 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9DA42 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9DA42 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms