Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sgf29Q9DA08 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sgf29Q9DA08 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms