Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot8Q9D8X5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnot8Q9D8X5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms