Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SlirpQ9D8T7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms