Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jam3Q9D8B7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms