Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fip1l1Q9D824 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms