Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capns2Q9D7J7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capns2Q9D7J7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms