Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc9bQ9D6E4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms