Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lpcat2bQ9D5U0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms