Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3a3Q9D554 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sf3a3Q9D554 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms