Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc130Q9D516 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms