Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D4W2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D4W2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms