Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4933428M09RikQ9D3X3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms