Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ankrd39Q9D2X0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms