Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tmed11Q9D2R4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed11Q9D2R4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms