Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Susd3Q9D176 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms