Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem53Q9D0Z3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms