Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrto4Q9D0I8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrto4Q9D0I8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms