Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms