Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sgo1Q9CXH7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sgo1Q9CXH7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sgo1Q9CXH7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sgo1Q9CXH7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sgo1Q9CXH7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sgo1Q9CXH7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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