Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms