Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2310003L06RikQ9CV82 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
2310003L06RikQ9CV82 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms