Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnpda2Q9CRC9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms