Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkiras2Q9CR56 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkiras2Q9CR56 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkiras2Q9CR56 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkiras2Q9CR56 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkiras2Q9CR56 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkiras2Q9CR56 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkiras2Q9CR56 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms