Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CR55 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CR55 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CR55 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CR55 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms