Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PclafQ9CQX4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PclafQ9CQX4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms