Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Nicn1Q9CQM0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Nicn1Q9CQM0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms