Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Timm22Q9CQ85 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms