Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700029P11RikQ9CQ68 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms