Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms