Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms