Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bhlhe41Q99PV5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms