Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim12aQ99PQ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim12aQ99PQ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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