Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtf2a1Q99PM3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtf2a1Q99PM3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms